Genomas · Rhodnius prolixus
Descrevemos a primeira sequência do genoma de um inseto vetor não-díptero de uma importante doença parasitária humana, a doença de Chagas.
Explorar o genoma →
O que investigamos
Áreas de pesquisa
Sete frentes que se conectam — os mesmos dados de genoma e expressão alimentam a modelagem de proteínas, os modelos metabólicos e o aprendizado de máquina. Clique em uma área para ver a descrição completa, quem atua nela e as publicações.
Vetores e parasitos
Genoma e biologia do barbeiro Rhodnius prolixus, vetor da doença de Chagas, e de outros artrópodes de interesse médico.
1 pessoa hoje27 publicações
Genômica
Montagem, anotação e análise comparativa de genomas, com ênfase em insetos vetores de doenças.
5 pessoas hoje10 publicações
Transcriptômica
Montagem de transcriptomas e análise de expressão gênica diferencial em diferentes tecidos e condições.
3 pessoas hoje5 publicações
Proteínas e enzimas
Modelagem estrutural, docking e prospecção de enzimas e proteínas de interesse biotecnológico e farmacológico.
+16 pessoas hoje18 publicações
Biologia de sistemas e modelagem metabólica
Reconstrução de modelos metabólicos em escala genômica para entender e otimizar a produção de compostos de interesse industrial.
2 pessoas hoje
Inteligência artificial e aprendizado de máquina
Machine learning aplicado a dados genômicos e transcriptômicos para encontrar padrões, classificar amostras e priorizar genes.
2 pessoas hoje
Biomedicina
Aplicações da bioinformática a questões biomédicas, como oncologia e resistência a antibióticos.
3 pessoas hoje2 publicações
As fotos mostram quem da equipe atual trabalha em cada área hoje. O número de publicações é o histórico do laboratório na área — os membros atuais não são necessariamente autores desses artigos.
O que desenvolvemos
Projetos desenvolvidos
EUGENE®
EUGENE é um menino que adora genética e que aprendeu a encontrar os genes com a ajuda de Mendel e das ervilhas — ajude você também caçando as palavras no genoma.
Conhecer o Eugene →
Gene Selector for Validation v1.0
Uma ferramenta capaz de indicar candidatos a genes de referência e de validação para o seu RT-qPCR.
Ver no GitHub →
Ensino
Disciplinas
Pós-graduação
-
Bioinformática Básica — IQB723
Esta disciplina é normalmente oferecida no primeiro semestre.
-
Bioinformática: Genomas e Transcriptomas — IQB724
Esta disciplina é normalmente oferecida no segundo semestre.
Onde estamos
Informações e contato
Rafael Dias Mesquita
DBq / IQ / UFRJ
Av. Athos da Silveira Ramos, 149 — prédio CT, bloco A, sala 535, Ilha do Fundão
Rio de Janeiro, RJ, Brasil — CEP 21941-909
Telefone: +55 21 3938-7356
E-mail: bioinformatica.iq.ufrj@gmail.com