Seleção aberta Iniciação Científica, vaga ABERTA, Setembro de 2024 - para início IMEDIATO - COM BOLSA
Título do projeto: Predição de mutações em proteínas alvo de antibióticos Orientador: Rafael Dias Mesquita (Departamento de Bioquímica / Instituto de Química / UFRJ) Público alvo: Alunos de graduação de áreas biológicas com conhecimentos/interesse computacionais ou alunos de computação com conhecimento/interesse biológico. Área do CNPq: Biotecnologia. Inserção de área prioritária: II. Tecnologias Habilitadoras, nos setores de Inteligência Artificial e Biotecnologia. Requisitos: 1) SER ALUNO DA UFRJ, 2) CRA maior ou igual a sete, 3) Disponibilidade de 16h presenciais no laboratório, 4) Não ter outra bolsa de IC, monitoria ou outra bolsa não acumulável, seguindo as normas do edital 2024, disponível em https://pibic.ufrj.br/ , 5) Não ter outra IC, mesmo sem bolsa. Desejável: Já ter cursado bioquímica e interesse por computador pois o projeto é completamente computacional (conhecimentos de programação são interessantes), inglês para leitura de artigos científicos. Vagas: 01 Contato: enviar email ATÉ 01/10/2024 incluindo o histório da graduação e CV para o email bioinformatica.iq.ufrj@gmail.com Os alunos selecionados passarão por entrevista para a escolha final. A data de implementação da bolsa é até 10/10/2024 para recebimento no mês seguinte.
Últimas seleções Iniciação Científica, vaga ABERTA, Novembro de 2022 - para início em 2023
Projeto: A doença de Chagas é uma doença tropical negligenciada que somente possui tratamento paliativo, logo, deve ser contida por medidas de urbanização e controle vetorial. O Rhodnius prolixus é um importante vetor na América Latina, sendo o primeiro triatomíneo a ter seu genoma sequenciado e analisado por um grupo internacional. A versão de montagem do seu genoma mais atual (Hi-C) e sua predição gênica, assim como todas as montagens de genoma anteriores, suas predições gênicas e dados de RNAseq foram disponibilizados em um navegador de genomas hospedado internamente no site do nosso laboratório. Este projeto objetiva a organização destes dados no domínio triatominebase.org e manutenção/correção dos dados genômicos. A disponibilidade destes dados corretamente poderá fomentar os estudos biológicos e de controle vetorial com o inseto. Além de possibilitar estudos comparativos com outras espécies de triatomíneos. Orientador: Rafael Dias Mesquita (Departamento de Bioquímica / Instituto de Química / UFRJ) Público alvo: Alunos de graduação de áreas biológicas com conhecimentos/interesse computacionais ou alunos de computação com conhecimento/interesse biológico. Desejável: Disponibilidade de 16 horas presenciais no laboratório (ver localização no site), interesse por computador pois o projeto é completamente computacional (conhecimentos de programação são interessantes), inglês para leitura de artigos científicos, não ter outra IC, CRA acima de 7 para podermos solicitar bolsa FAPERJ (Este projeto será submetido para pedido de 1 bolsa de IC em 2023). Vagas: 01 Contato: enviar email descrevendo o motivo do interesse e incluindo o histório da graduação e CV para o email bioinformatica.iq.ufrj@gmail.com
Iniciação Científica, Agosto de 2022
Projeto: Estima-se que as superbactérias causem 700.000 mortes por ano, sendo 23 mil no Brasil (WHO, 2017). Este projeto objetiva desenvolver um software com inteligência artificial para antecipar mutações que levem a resistência a antibióticos, embasando assim seu desenvolvimento. Esta primeira etapa identificou o antibiótico X, o organismo Y e as proteínas Z e W para estudo como prova de conceito, devido a importância médica, disponibilidade cristalográfica e de mutações conhecidas. As perspectivas para o próximo biênio são realizar os redockings antibiótico-proteína (selvagem e mutantes conhecidos) e criar modelos tridimensionais com novas mutações hipotetizadas. Orientador: Rafael Dias Mesquita (Departamento de Bioquímica / Instituto de Química / UFRJ) Público alvo: Alunos de graduação de áreas biológicas com conhecimentos/interesse computacionais ou alunos de computação com conhecimento/interesse biológico. Desejável: Disponibilidade de 16 horas presenciais no laboratório (ver localização no site), interesse por computador pois o projeto é completamente computacional (conhecimentos de programação são interessantes), inglês para leitura de artigos científicos, não ter outra IC, CRA acima de 7 para concorrer a bolsa PIBIC (Este projeto será submetido para pedido de 1 bolsa de IC). Vagas: 01 Contato: enviar email descrevendo o motivo do interesse e incluindo o histório da graduação e CV para o email